微生物檢測(cè)崗位職責(zé)：1.負(fù)責(zé)產(chǎn)品無(wú)菌檢查、微生物限度檢查、細(xì)菌內(nèi)檢查、支原體及外源病毒的分析方法開(kāi)發(fā)、驗(yàn)證；2.對(duì)產(chǎn)品及環(huán)境實(shí)施無(wú)菌檢查、微生物限度檢查、細(xì)菌內(nèi)檢查；3.對(duì)原輔料、內(nèi)包材、工藝用水等實(shí)施微生物限度、細(xì)菌內(nèi)檢查；4.對(duì)微生物實(shí)驗(yàn)室的試劑、耗材、儀器等實(shí)施日常管理；5.對(duì)實(shí)驗(yàn)室菌種管理、進(jìn)行培養(yǎng)基的促生長(zhǎng)試驗(yàn)、無(wú)菌試驗(yàn)的陽(yáng)性對(duì)照試驗(yàn)；6.進(jìn)行潔凈區(qū)日常環(huán)境監(jiān)控及無(wú)菌區(qū)人員更衣確認(rèn)；7.對(duì)關(guān)鍵檢測(cè)數(shù)據(jù)進(jìn)行定期的趨勢(shì)分析；8.完成上級(jí)安排的其他事宜。病原微生物檢測(cè)的不可知性使得高通量測(cè)序成為研究這類病原微生物的有用工具。隨機(jī)PCR微生物篩查方法

微生物鑒定的傳統(tǒng)的鑒定方法雖然仍被普遍使用，但存在兩大缺點(diǎn)。它們只適用于可以體外培養(yǎng)的生物體，而且一些菌株表現(xiàn)出不符合已知種屬模式的獨(dú)特的生化特性。許多現(xiàn)代方法并不依賴于活的培養(yǎng)物，它們常常能揭示通過(guò)傳統(tǒng)方法檢測(cè)不到的有機(jī)體之間的細(xì)微差別。PCR，包括實(shí)時(shí)熒光定量PCR，可能是普遍應(yīng)用于微生物鑒定的分子技術(shù)。利用PCR技術(shù)，可以快速檢測(cè)和鑒定臨床標(biāo)本的微生物種類，從而加快診斷程序。大多數(shù)基于PCR的方法涉及一組通用的PCR引物，通過(guò)測(cè)序PCR擴(kuò)增的序列來(lái)鑒定細(xì)菌/樣品。16SrRNA基因是PCR細(xì)菌鑒定的金標(biāo)準(zhǔn)序列，而內(nèi)部轉(zhuǎn)錄間隔區(qū)(ITS)區(qū)域是種類的主要條碼標(biāo)記。隨機(jī)PCR微生物篩查方法病毒研究的發(fā)展常常與病毒培養(yǎng)和檢測(cè)方法的進(jìn)步有密切的關(guān)系。

傳統(tǒng)的血清學(xué)與分子生物學(xué)方法如ELISA與PCR，由于病原微生物的特異性差異，有時(shí)只能用于病原微生物特定種甚至特定種特定株系分離物的檢測(cè)；而電鏡與生物學(xué)接種鑒定方法又難以將病原微生物鑒定至物種水平。相比之下，高通量測(cè)序技術(shù)可以提供一條新的病原微生物鑒定途徑。病原微生物檢測(cè)的不可知性使得高通量測(cè)序成為研究這類病原微生物的有用工具。目前，該技術(shù)在人類與動(dòng)植物病原微生物的鑒定中已經(jīng)有較多的應(yīng)用。高通量測(cè)序在臨床virology領(lǐng)域的應(yīng)用病毒作為一種古老的物種存在于自然界，幾乎能夠在任何物種寄生，與人類健康息息相關(guān)。雖然大部分病毒沒(méi)有出現(xiàn)明顯的臨床癥狀，少數(shù)病毒能夠引起人類多種疾病，表現(xiàn)出包括發(fā)熱、腹瀉、出血、出疹、呼吸道癥狀、神經(jīng)系統(tǒng)癥狀等。

微生物怎么進(jìn)行檢測(cè)？通過(guò)顯微鏡直接觀察。一般來(lái)說(shuō)，在一定的培養(yǎng)條件下（相同的培養(yǎng)基、溫度以及培養(yǎng)時(shí)間），同種微生物表現(xiàn)出穩(wěn)定的菌落特征。這些特征包括菌落的形狀、大小、隆起程度和顏色等方面。因此可以通過(guò)顯微鏡觀察菌落特征對(duì)微生物種類進(jìn)行判斷。使用選擇培養(yǎng)基培養(yǎng)微生物或人為提供有利于目的菌株生長(zhǎng)的條件。選擇培養(yǎng)基，顧名思義其作用是允許特定種類的微生物生長(zhǎng)，同時(shí)控制或阻止其他微生物生長(zhǎng)。例如，使用以尿素作為氮源的培養(yǎng)基能夠培養(yǎng)出可合成脲酶的微生物；在培養(yǎng)基中ph調(diào)至酸性有利于霉菌的生長(zhǎng)繁殖（控制細(xì)菌的生命活動(dòng)）等。選擇培養(yǎng)一般是通過(guò)觀察微生物的同化作用類型或某一特征進(jìn)行間接判斷，得到的微生物往往并不只有一種，但是能夠大致確定這些微生物存在的共有特征從而對(duì)其分類。高通量測(cè)序技術(shù)問(wèn)世，給微生物鑒別打開(kāi)一扇新的大門(mén)。

未知病原鑒定測(cè)序?qū)嶒?yàn)基于二代測(cè)序技術(shù)。樣本經(jīng)過(guò)核酸純化-文庫(kù)構(gòu)建-生物信息學(xué)分析這3大基本流程后轉(zhuǎn)換成了病原體的序列數(shù)據(jù)。首先，在核酸純化環(huán)節(jié)，探普提供專門(mén)針對(duì)病原的核酸純化樣本指南，以提高病原純度和得率，與此同時(shí)探普生物也提供核酸純化服務(wù)。第二，文庫(kù)構(gòu)建環(huán)節(jié)，探普生物專門(mén)針對(duì)病原樣本的核酸低濃度/超微總量特點(diǎn)開(kāi)發(fā)了超微量核酸文庫(kù)構(gòu)建，可以將0.01ng/μl甚至更低濃度的核酸構(gòu)建成測(cè)序文庫(kù)。第三，生物信息學(xué)分析環(huán)節(jié)。因?yàn)椴≡话闶窃趶?fù)雜環(huán)境或背景中獲得的，因此下機(jī)數(shù)據(jù)一般都伴隨大量的宿主和其他非致病微生物的數(shù)據(jù)，探普生物基于該特點(diǎn)，優(yōu)化了自有數(shù)據(jù)庫(kù)，專門(mén)針對(duì)病原數(shù)據(jù)搭載了生物信息學(xué)分析流程，可處理復(fù)雜背景下的病原序列。面對(duì)未知病毒，抵抗力是我們健康的屏障。隨機(jī)PCR微生物篩查方法

大多微生物鑒定系統(tǒng)采用細(xì)菌分解底物后反應(yīng)液中pH的變化。隨機(jī)PCR微生物篩查方法

微生物檢測(cè)中含有一種以上的微生物培養(yǎng)物稱為混和培養(yǎng)物。如果在一個(gè)菌落中所有細(xì)胞均來(lái)自于一個(gè)親代細(xì)胞，那么這個(gè)菌落稱為純培養(yǎng)(pureculture)。在進(jìn)行菌種鑒定時(shí)，所用的微生物一般均要求為純的培養(yǎng)物。得到純培養(yǎng)的過(guò)程稱為分離純化，方法有許多種。先把微生物懸液通過(guò)一系列稀釋，取一定量的稀釋液與熔化好的保持在40-50℃左右的營(yíng)養(yǎng)瓊脂培養(yǎng)基充分混合，然后把這混合液傾注到無(wú)菌的培養(yǎng)皿中，待凝固之后，把這平板倒置在恒箱中培養(yǎng)。單一細(xì)胞經(jīng)過(guò)多次增殖后形成一個(gè)菌落，取單個(gè)菌落制成懸液，重復(fù)上述步驟數(shù)次，便可得到純培養(yǎng)物。隨機(jī)PCR微生物篩查方法