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首頁-廣州單細(xì)胞BCR測序數(shù)據(jù)分析





更新時間:2025-12-21
簡要描述: 空間轉(zhuǎn)錄組測序的數(shù)據(jù)質(zhì)量和玻片有效區(qū)域的利用率、貼片的質(zhì)量和透化時間息息相關(guān)。貼片質(zhì)量不良會影響總的有效spot數(shù)等;而

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空間轉(zhuǎn)錄組測序的數(shù)據(jù)質(zhì)量和玻片有效區(qū)域的利用率、貼片的質(zhì)量和透化時間息息相關(guān)。貼片質(zhì)量不良會影響總的有效spot數(shù)等;而透化不合理會導(dǎo)致spot的reads數(shù)、基因中位數(shù)等參數(shù)。而 在特異性基因表達(dá)方面,我們也可以統(tǒng)計空間轉(zhuǎn)錄組群體的特異性基因表達(dá)即Markergene,將他們在組織切片以及空轉(zhuǎn)上進(jìn)行著色。我們也可以對于任意一個已知的基因或者數(shù)據(jù)庫中的一些細(xì)胞Marker,然后將其在基因表達(dá)在空間轉(zhuǎn)錄組的切片以及HE染色上展示自己的基因表達(dá)進(jìn)而了解,群體中的可能的細(xì)胞組成關(guān)系。 烈冰測序數(shù)據(jù)分析平臺,不依賴已有物種信息,可研究非模式物種,針對不同平臺的數(shù)據(jù),制定多套流程;廣州單細(xì)胞BCR測序數(shù)據(jù)分析
烈冰科技作為國內(nèi)同時擁有10X Genomics和BD Rhapsody雙分選平臺的測序服務(wù)商及云計算服務(wù)供應(yīng)商,經(jīng)過多年實(shí)戰(zhàn),擁有豐富的單細(xì)胞懸液制備和分選經(jīng)驗,實(shí)測BD Rhapsody對能夠高效捕獲粒細(xì)胞。針對不同的分選平臺、建庫方法,實(shí)戰(zhàn)總結(jié)搭建出不同的數(shù)據(jù)預(yù)處理工作流程;烈冰科技NovelBrain?生物大數(shù)據(jù)平臺能有效支撐生命科學(xué)研究、醫(yī)療健康等領(lǐng)域?qū)Υ髷?shù)據(jù)分析的需求。完備的高通量測序?qū)嶒炂脚_,包括NovaSeq 6000、10X Chromium X、BD FACSMelody、PANNORAMIC數(shù)字切片掃描儀等,配合一支來自海內(nèi)外名校、多學(xué)科交叉型的高素質(zhì)綜合團(tuán)隊,為您的科學(xué)研究保駕護(hù)航。廣州單細(xì)胞BCR測序數(shù)據(jù)分析單細(xì)胞測序數(shù)據(jù)分析,認(rèn)準(zhǔn)烈冰NovelBrain生物信息數(shù)據(jù)分析平臺。
多樣本數(shù)據(jù)合并:Fraction of Reads Kept:合并樣本時,各樣本根據(jù)Mapped Barcoded Reads per Cell數(shù)量計算出來的數(shù)據(jù)利用率。如果各樣本間該參數(shù)值相差很大,需要進(jìn)行Downsample處理,以數(shù)據(jù)量少的樣本為基準(zhǔn)將不同樣本中細(xì)胞測序深度標(biāo)化到同一水平,從而避免因測序深度差異導(dǎo)致的基因檢測數(shù)量、基因表達(dá)水平的差異。烈冰科技自主研發(fā)的單細(xì)胞云平臺致力于幫助每一位客戶定制化分析數(shù)據(jù),深入解讀數(shù)據(jù)分析結(jié)果,深入挖掘其背后的生物學(xué)意義;從操作便捷、結(jié)果可視化、分析可追溯、系統(tǒng)穩(wěn)定等方面助力單細(xì)胞研究,加速科研進(jìn)程!
單細(xì)胞測序是指針對單個細(xì)胞進(jìn)行全轉(zhuǎn)錄組測序分析,可精確地描述每一個細(xì)胞的狀態(tài),在異質(zhì)性發(fā)育過程中具有不可忽視的應(yīng)用價值。然而,單細(xì)胞測序無法給出固態(tài)異質(zhì)化組織中細(xì)胞空間排布信息,對于揭示發(fā)育過程、病理微環(huán)境都存在很大的局限性。空間轉(zhuǎn)錄組測序以點(diǎn)陣形式記錄病理切片細(xì)胞的空間信息并進(jìn)行測序,可以精確指示點(diǎn)陣內(nèi)的全部基因表達(dá)情況??臻g轉(zhuǎn)錄組測序的加入,無疑讓單細(xì)胞測序如虎添翼,更精確地勾勒了組織水平的異質(zhì)性。個性化制定測序項目方面,滿足從檢測基因到蛋白的多組學(xué)測序要求。
單細(xì)胞測序結(jié)果動輒上百G數(shù)據(jù)量,龐大的數(shù)據(jù)對于分析平臺和分析能力有著很高的要求,首先針對下機(jī)數(shù)據(jù)的質(zhì)控環(huán)節(jié):單細(xì)胞測序產(chǎn)生數(shù)億的結(jié)果序列,不可避免的會出現(xiàn)低質(zhì)量的測序結(jié)果,存在各種情況的序列污染。因此序列過濾及質(zhì)量評估就會變得極為重要。序列質(zhì)量主要通過測序質(zhì)量值Q20/Q30的占比來表征,即堿基測序結(jié)果的錯誤率在1% / 0.1%以下的比例。理想的測序結(jié)果reads的堿基質(zhì)量均高于30。保證數(shù)據(jù)獲得后第一步的處理結(jié)果的準(zhǔn)確性,為后續(xù)細(xì)胞類型鑒定準(zhǔn)確和功能分析打下堅實(shí)基礎(chǔ)。單細(xì)胞測序技術(shù)提供了單個細(xì)胞水平下的科學(xué)研究視角。廣州單細(xì)胞BCR測序數(shù)據(jù)分析
國產(chǎn)化PanoCell單細(xì)胞測序平臺,提供高性價比服務(wù)方案。廣州單細(xì)胞BCR測序數(shù)據(jù)分析
烈冰生物已空間轉(zhuǎn)錄組測序服務(wù)提供從一個組織切片樣本中獲取包括空間信息在內(nèi)的全部轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù),從而可以區(qū)分和定位功能基因在特定組織區(qū)域內(nèi)的活躍表達(dá)。其可以檢測組織樣本中的所有基因活動,并繪制活動發(fā)生的位置,這將有助于科學(xué)家更好地構(gòu)建生物圖譜,并進(jìn)一步理解疾病和生物學(xué)過程。目前,空間轉(zhuǎn)錄組主要應(yīng)用于多種疾病、免疫、發(fā)育、神經(jīng)和病理學(xué)等研究領(lǐng)域。烈冰生物具有專業(yè)的實(shí)驗團(tuán)隊、豐富的切片經(jīng)驗,配置了國際主流的儀器設(shè)備,實(shí)驗團(tuán)隊針對不同組織類型優(yōu)化完善實(shí)驗方案,并制定了嚴(yán)謹(jǐn)規(guī)范的實(shí)驗室SOP流程,保證空間轉(zhuǎn)錄組切片的質(zhì)量,全優(yōu)保障測序數(shù)據(jù)質(zhì)量。廣州單細(xì)胞BCR測序數(shù)據(jù)分析
上海烈冰生物醫(yī)藥科技有限公司擁有生物科技、醫(yī)藥科技、信息科技、計算機(jī)科技領(lǐng)域內(nèi)的技術(shù)開發(fā)、技術(shù)服務(wù)、技術(shù)轉(zhuǎn)讓、技術(shù)咨詢,市場營銷策劃,市場信息咨詢與調(diào)查(不得從事社會調(diào)查、社會調(diào)研、民意調(diào)查、民意測驗),從事貨物及技術(shù)的進(jìn)出口業(yè)務(wù),計算機(jī)、軟件及耗材(除??兀?,軟件開發(fā)【依法須經(jīng)批準(zhǔn)的項目,經(jīng)相關(guān)部門批準(zhǔn)后方可開展經(jīng)營活動】等多項業(yè)務(wù),主營業(yè)務(wù)涵蓋單細(xì)胞測序,生物大數(shù)據(jù)云分析平臺,空間轉(zhuǎn)錄組測序,單細(xì)胞多組學(xué)測序。公司目前擁有較多的高技術(shù)人才,以不斷增強(qiáng)企業(yè)重點(diǎn)競爭力,加快企業(yè)技術(shù)創(chuàng)新,實(shí)現(xiàn)穩(wěn)健生產(chǎn)經(jīng)營。公司業(yè)務(wù)范圍主要包括:單細(xì)胞測序,生物大數(shù)據(jù)云分析平臺,空間轉(zhuǎn)錄組測序,單細(xì)胞多組學(xué)測序等。公司奉行顧客至上、質(zhì)量為本的經(jīng)營宗旨,深受客戶好評。公司深耕單細(xì)胞測序,生物大數(shù)據(jù)云分析平臺,空間轉(zhuǎn)錄組測序,單細(xì)胞多組學(xué)測序,正積蓄著更大的能量,向更廣闊的空間、更寬泛的領(lǐng)域拓展。
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